11 августа 1613 года Новохолмогоры были переименованы в Архангельский город.

В 1584 году по указу царя Ивана Грозного была «писана на Москве» грамота царя Ивана IV двинским воеводам Нащёкину и Залешанину-Волохову с указанием «поставить город». Основание города происходило очень торжественно - на берегу собрались строители, воеводы и священники. Столбиками отмечались линии стен и башен, священник следовал за строителями и кропил разбивку святой водой.

Новый город был построен в один год и представлял собой деревянную крепость, которая окружала монастырь. Стена со стороны реки была двойной и наполнена камнями и землей. Основными элементами крепости были башни с установленными на них пушками.

Город тогда был назван Новым городом или Новохолмогорами. Холмогоры были с XV века торговым центром новгородцев в Двинском регионе, и 200 стрельцов из Холмогор стали первыми жителями Нового города. Позже к ним присоединились еще 130 семей из разных двинских деревень. Через 5 лет город уже насчитывал 138 домов, а в 1588 году там была построена первая деревянная церковь с колокольней.

Официальное название города Новохолмогоры не прижилось среди его жителей, они называли его Архангельским городом - по имени монастыря. Поэтому данное правительством имя скоро вышло из употребления, а 11 сентября 1613 года город получил административную самостоятельность и новое имя -  Архангельский город или Архангельск.