Имущественный вычет работнику предоставляется работодателем с начала года. 

 Согласно пункту 15 Обзора практики рассмотрения судами дел, связанных с применением главы 23 Налогового кодекса Российской Федерации, утвержденного Президиумом Верховного Суда РФ 21.10.2015, при обращении физического лица с заявлением о предоставлении имущественного налогового вычета не в первом, а в одном из последующих месяцев календарного года налог исчисляется за весь истекший с начала года период с применением имущественного налогового вычета.

Например, если налогоплательщик обратился к работодателю за получением имущественного налогового вычета в апреле 2016 года, предоставив уведомление из налоговой инспекции, то налоговый агент при определении налоговой базы нарастающим итогом за период январь – апрель 2016 должен учесть все доходы, полученные работником с начала года, и к полученной сумме применить имущественный налоговый вычет (т.е. произвести перерасчет налога с начала года).

Разница между суммой налога, исчисленной и удержанной до предоставления имущественного вычета, и суммой налога, определенной с учетом вычета, образует сумму налога, излишне перечисленную в бюджет.

На основании п. 1 ст. 231 НК излишне удержанная налоговым агентом из дохода налогоплательщика сумма налога подлежит возврату налоговым агентом. Возврат излишне удержанной суммы налога производится за счет сумм НДФЛ, подлежащих перечислению в счет предстоящих платежей, в том числе и за счет налога по другим работникам.

 ИФНС России по г. Архангельску